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设计的 TNFα VHH 与参考 TNFα VHH（5M2J）在 10 个对齐的 CDR 位置上有差异，包括两个插入 / 删除事件，表明抗原识别区域存在实质性分歧而非简单地对现有结合物进行点替换。

参考结构检索 对于每个靶标，使用靶标蛋白序列通过序列相似性搜索（同一性阈值 80%）从 RCSB PDB 检索已知复合物结构，并与 SAbDab 数据库交叉注释，将条目分类为 VHH 复合物、IgG/Fab 复合物或天然蛋白 - 蛋白复合物。

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传统方法往往用 one-hot 向量或文本嵌入表示功能标签，但蛋白功能并不是抽象语义本身，而是由具体的局部结构基序承载。

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如果 AI 研究系统未来真的要进入实验、复现、调参与迭代的日常流程，那么它最终必须以工具形态存在，成为研究者工作流的一部分，而不只是论文中的一个分数。

编辑 | 程婷 综合 | 天津气象 中央气象台据中国海事局消息，福建海事局发布军事演习—闽航警126/26。

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